Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Spatc1Q148B6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spatc1Q148B6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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