Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VgfQ0VGU4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms