Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli2Q0VGT2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms