Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp4r2Q0VGB7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r2Q0VGB7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms