Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc39dQ0VF76 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ttc39dQ0VF76 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ttc39dQ0VF76 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ttc39dQ0VF76 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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