Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne7Q0VE82 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne7Q0VE82 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms