Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tigd2Q0VBL1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tigd2Q0VBL1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms