Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spata18Q0P557 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms