Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kndc1Q0KK55 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms