Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21bQ0HA38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms