Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calb2Q08331 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms