Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms