Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col9a2Q07643 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms