Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms