Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CluQ06890 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CluQ06890 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CluQ06890 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CluQ06890 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CluQ06890 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms