Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrstQ06666 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms