Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms