Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs3Q05895 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms