Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rcn1Q05186 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcn1Q05186 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms