Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms