Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox9Q04887 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms