Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcad1Q04692 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms