Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcr5Q04683 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr5Q04683 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms