Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms