Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelaQ04207 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelaQ04207 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RelaQ04207 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms