Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms