Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms