Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col6a2Q02788 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms