Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GscQ02591 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GscQ02591 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GscQ02591 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GscQ02591 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GscQ02591 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GscQ02591 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GscQ02591 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms