Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcqQ02111 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms