Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms