Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RykQ01887 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RykQ01887 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RykQ01887 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RykQ01887 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RykQ01887 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RykQ01887 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RykQ01887 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RykQ01887 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RykQ01887 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms