Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms