Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme2Q01768 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms