Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms