Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Top2aQ01320 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms