Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms