Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja5Q01231 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms