Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms