Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms