Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VegfaQ00731 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VegfaQ00731 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VegfaQ00731 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VegfaQ00731 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VegfaQ00731 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms