Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms