Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd80Q00609 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms