Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax8Q00288 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax8Q00288 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax8Q00288 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax8Q00288 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax8Q00288 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax8Q00288 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms