Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx2Q00262 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms