Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PgrQ00175 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms