Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AlkP97793 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AlkP97793 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AlkP97793 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AlkP97793 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AlkP97793 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AlkP97793 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AlkP97793 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AlkP97793 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AlkP97793 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AlkP97793 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AlkP97793 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AlkP97793 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AlkP97793 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AlkP97793 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AlkP97793 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms