Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mesp1P97309 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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