Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubg1P83887 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms