Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx1P80205 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms